Xã Hòa Thành có địa hình tương đối bằng phẳng, liền vùng, ít bị chia cắt, độ cao trung bình là 0.05%, cao độ nền tự nhiên trung bình tử +2,5 m đến 3m, khu vực thấp có cao độ nền từ +0,5 m đến 1,5m. Về đất đai, xã Hòa Thành có 1.029,31 ha đất nông nghiệp, chiếm 62,50% diện tích tự nhiên, trong đó diện tích trồng lúa chiếm 750,95ha; đất song suối và mặt nước chuyên dung có 134,40ha; đất bằng chưa sử dụng có 265,48 ha, chiếm 16,12% diện tích tự nhiên, chủ yếu là đất bãi bồi và cát xây dựng ven sông Đà Rằng.

Thôn Phú lễ ở về phía đông bắc xa, đất sản xuất phần lớn là soi biển ven song, thuận lợi cho việc trồng hoa, rau dưa, chăn nuôi gia súc. Ngày trước đường thiên lý đi qua Phú lễ, có bến đò Phú Lễ nối 2 bờ nam bắc song Đà Rằng. Kho có tuyến Quốc lộ 1 đia qua Phú lêm thì Phú Lễ trở nên vắng vẻ. Lúc tuyến tránh Quốc lộ 1 mở ra đi qua phía tây Phú Lễ, sinh hoạt của thôn sinh động trở lại. Hai thôn Phước Bình Nam, Phước Bình Bắc nằm trong vùng hạ lưu song Đà Rằng, địa thế bằng phẳng, ruộng nhiều, thuộc vùng trọng điểm luacs của đồng bằng Tuy Hòa. Thôn Phước Lộc có dòng song và nhánh phụ chảy theo hướng Tây Nam, ngày trước đất gia cư, hoang nhàn và mộ địa rất nhiều so với các làng khác. Nay có đường ĐT 645 và kênh chính thủy nông Đồng Cam đi qua, cư dân đông đức, cuộc sồng trù phú.

Nằm dọc ranh giới phía Bắc xã có con song Đà Rằng chảy qua, với lưu lượng nước các tháng trong năm như: Trang các tháng mùa lũ (từ tháng 9 đến tháng 12) có lưu lượng nước cao hơn mức trung bình; các tháng mùa cạn (từ tháng 1 đến tháng 8) có lưu lượng nước thấp hơn mức trung bình). Do chế độ nước song phụ thuộc vào chế độ mưa. Ở Duyên hải miền Trung nước ta có mừa mưa muộn lệch về thu đông nên mùa lũ của sông cũng vào thời kỳ thu đông.

Trên phía thượng nguồn Sông Ba (Đà Rằng) có nhiều công trình thủy điện, trong đó mỗi khi mưa lớn các hồ thủy điện xả lũ, lượng nước tràn xuống quá lớn gây ngập lụt ở các xã hạ du, trong đó có địa bàn xã Hòa Thành. Hệ thống kênh, mương, bầu trên địa bàn xã góp phần cung cấp một lượng nước rất lớn cho sinh hoạt và sản xuất nông nghiệp của người dân.

Xã Hòa Thành nằm trong vùng khí hậ Duyên hải miền Trung, mỗi năm chia làm 02 mùa rõ rệt: mùa nắng và mùa mưa. Vào mùa mưa, sông Đà Rằng thường có lụt, có năm lụt rất lớn gây thiệt hại nghiêm trọng kết cấu hạ tầng, mùa màng, tài sản, tính mạng nhân dân trong xã. Nhưng bù lại, lũ lụt đã bồi đắp cho ruộng đồng, soi bãi một lớp phù sa mới, màu mỡ.